KURS - Metody klasteryzacji hierarchicznej w biologii

 

 PTG - logoIOPAN - logoekologia środowisko przyroda - artykuły i wiadomości

Odział Gdański Polskiego Towarzystwa Genetycznego, przy współpracy Instytutu Oceanologii PAN i Sopockiego Towarzystwa Naukowego, zaprasza na drugą edycję trzydniowego kursu pod tytułem:Metody klasteryzacji hierarchicznej w biologii4-6 lutego 2010.

Celem kursu jest przybliżenie uczestnikom metod klasteryzacji danych biologicznych. Warsztaty obejmują zarówno wykłady jak i zastosowanie omawianych metod. Ćwiczenia będą wykonywane w pakiecie R (Freeware).

 

Plan zajęć:

 

4 lutyprowadzący dr hab. Borys Wróbel / mgr Joanna Całkiewicz (Instytut Oceanologii PAN, Sopot)

·       Wstęp do pakietu statystycznego R.

 

5 luty – prowadzący dr Przemysław Biecek (Instytut Matematyki Stosowanej i Mechaniki, UW)

 

·       Wprowadzenie do analizy skupień oraz do hierarchicznej analizy skupień. Prosty przykład wyznaczania dendrogramu (metoda przez łączenie).

 

·       Różne metody wyznaczania odległości pomiędzy obiektami oraz różne kryteria łączenia grup.

 

·       Inne algorytmy grupowania, grupowanie przez podział, algorytmy grupowania dużych zbiorów danych i grupowanie rozmyte (metody: diana, clara, mona).

 

6 luty – prowadzący dr Przemysław Biecek (Instytut Matematyki Stosowanej i Mechaniki, UW)

 

·       Bootstrapowe metody oceny stabilności grupowania (pakiet pvclust).

 

·       Techniki skalowania wielowymiarowego i ich związek z analizą skupień.

 

·       Inne zagadnienia związane z analizą skupień (likelihood linkage analysis z pakietu LLAhclust, wyszukiwanie skupień z pakietu dynamicTreeCut, klastrowanie hybrydowe z pakietu hybridHclust).

 

 

 

Cena kursu: 600

 

Opłata obejmuje: koszty zajęć praktycznych i wykładów, materiały szkoleniowe i koszty organizacyjne, poczęstunek w czasie przerw kawowych

 

Miejsce: Instytut Oceanologii PAN, ul. Powstańców Warszawy 55, Sopot

 

Data przyjmowania zgłoszeń: 25 styczeń 2010 (ilość miejsc ograniczona, decyduje kolejność zgłoszeń)

 

Więcej informacji: kurs.sopot@gmail.com lub tel.: +058 7311764

 

Opłatę należy wpłacić na konto (przelew proszę zatytułować „kurs-klasteryzacja” oraz proszę podać nazwisko uczestnika) :

 

Zarząd Główny Polskiego Towarzystwa Genetycznego
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
02-106 Warszawa, ul. Pawińskiego 5a

NIP 526-10-46-222
Bank Millenium, Warszawa
66116022020000000029252294

 

 

Prosimy o poinformowanie organizatorów o dokonaniu wpłaty: kurs.sopot@gmail.com

oraz umieszczenie w treści maila wypełnionej karty zgłoszenia.

 

 

Karta zgłoszenia:

 

Imię:

 

Nazwisko:

 

e-mail:

 

Telefon:

 

Dane do rachunku:

 

Czy uczestnik przyjedzie z własnym laptopem?:

 

Czy uczestnik będzie brał udział w pierwszym dniu kursu? :